Aplicación web iOS: transición entre la página y el parpadeo

Hice una aplicación web para dispositivos iOS y utilicé Bootstrap de Twitter, ya que admite un layout receptivo. El encabezado y el pie de página deberían comportarse como en una aplicación nativa: fijada a la parte superior o inferior. Lo conseguí utilizando la class CSS .navbar-fixed-top y .navbar-fixed-bottom .

Lamentablemente, durante la transición entre dos páginas, el encabezado y el pie de página parpadean y no parece "natural". Las barras deberían estar estáticas.

Preparé un website de muestra. Yo uso exactamente esta estructura. http://goo.gl/lmvzJ

¿Conoces un truco o una mejor soulution? ¡Gracias!

Si estás tratando de hacer algo así, seguiría y usaré Sencha touch para crear la aplicación. Cuesta dinero, pero es increíble para build una interfaz de usuario web. También puedes probar jquery mobile.